|
参数项
|
优化方案
|
传统离心柱法对照
|
|---|---|---|
|
样品来源
|
临床咽拭子样品60份(阳性20份、阴性40份,病毒载量10²-10⁶ copies/mL)
|
同批次平行样品
|
|
最优提取参数
|
裂解温度65℃、裂解时间10min,磁珠用量20μL,洗脱体积50μL,热盖温度105℃
|
按试剂盒说明书操作(裂解30min,洗脱50μL)
|
|
验证指标
|
核酸浓度(Nanodrop 2000)、PCR扩增Ct值、阳性检出率、重复性(n=6)
|
同左侧验证指标
|
|
样品类型
|
提取方法
|
平均核酸浓度(ng/μL)
|
平均Ct值
|
阳性检出率(%)
|
RSD(%)
|
单次提取时间(min)
|
|---|---|---|---|---|---|---|
|
高载量阳性样品(10⁵-10⁶ copies/mL)
|
TNE-9600Plus
|
1.82±0.04
|
23.56±0.32
|
100
|
1.23
|
32
|
|
高载量阳性样品(10⁵-10⁶ copies/mL)
|
离心柱法
|
1.48±0.06
|
25.12±0.45
|
100
|
2.15
|
120
|
|
低载量阳性样品(10²-10³ copies/mL)
|
TNE-9600Plus
|
0.35±0.01
|
34.28±0.51
|
100
|
2.28
|
32
|
|
低载量阳性样品(10²-10³ copies/mL)
|
离心柱法
|
0.28±0.02
|
37.85±0.63
|
85
|
3.89
|
120
|
|
阴性样品
|
TNE-9600Plus
|
0.08±0.01
|
无扩增
|
0
|
-
|
32
|
|
阴性样品
|
离心柱法
|
0.09±0.02
|
无扩增
|
0
|
-
|
120
|
|
参数项
|
鸡肉样品
|
牛奶样品
|
|---|---|---|
|
样品处理
|
均质后取25g样品,加入225mL缓冲液增菌6小时,取1mL增菌液用于提取
|
取10mL样品,加入90mL缓冲液增菌6小时,取1mL增菌液用于提取
|
|
最优提取参数
|
裂解温度75℃、裂解时间12min,磁珠用量25μL,洗脱体积60μL
|
裂解温度70℃、裂解时间10min,磁珠用量20μL,洗脱体积60μL
|
|
国标对比方法
|
GB 4789.42-2020增菌培养法(24小时增菌+生化鉴定)
|
同鸡肉方法
|
|
灵敏度验证
|
人工污染沙门氏菌(10¹-10⁴ CFU/g),计算检出限
|
人工污染沙门氏菌(10¹-10⁴ CFU/mL),计算检出限
|
|
样品类型
|
污染浓度(CFU/g/mL)
|
TNE-9600Plus检出率(%)
|
国标方法检出率(%)
|
平均提取浓度(ng/μL)
|
RSD(%)
|
总检测时间(h)
|
|---|---|---|---|---|---|---|
|
鸡肉
|
10⁴
|
100
|
100
|
2.15±0.05
|
1.42
|
7.5
|
|
鸡肉
|
10²
|
100
|
100
|
0.42±0.02
|
2.08
|
7.5
|
|
鸡肉
|
10¹
|
90
|
85
|
0.11±0.01
|
2.27
|
7.5
|
|
牛奶
|
10⁴
|
100
|
100
|
1.98±0.04
|
1.31
|
7.2
|
|
牛奶
|
10²
|
100
|
100
|
0.38±0.01
|
1.84
|
7.2
|
|
牛奶
|
10¹
|
92
|
88
|
0.10±0.01
|
2.15
|
7.2
|
